轉錄組分析平臺常見,但操作絲滑流暢的分析平臺,還得看烈冰的CytoNavigatorTM2023年9月發(fā)布至今,半年時間已有100多個課題組使用烈冰生物的CytoNavigatorTM單細胞數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)挖掘單細胞生物學意義。烈冰團隊再接再厲,開發(fā)了CytoNavigatorTM轉錄組分析系統(tǒng),全流程打通了轉錄組數(shù)據(jù)分析,并實現(xiàn)了毫秒級響應的GO/Pathway、網(wǎng)絡分析,以及高可交互的WGCNA、GSEA、趨勢分析等高級數(shù)據(jù)分析!
圖1:CytoNavigator 轉錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)的差異基因頁面
轉錄組分析流程成熟,分析平臺眾多。但目前的分析系統(tǒng)普遍存在結果碎片化、分析不夠流暢,可交互性差,需反復上傳基因表格等問題。基于上述情況,擁有多年轉錄組及生信云平臺經(jīng)驗的烈冰生物重拳出擊!
正式推出CytoNavigatorTM 轉錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)!一次解決RNA-seq分析的痛點,讓您享受數(shù)據(jù)分析的過程,輕松獲得高質量文章級圖片。
01 烈冰的傳統(tǒng)強項-轉錄組測序服務
烈冰生物自2010年起即深耕轉錄組領域,公司自主研發(fā)了多個轉錄組相關算法,如發(fā)表在期刊核酸研究以及Briefings In Bioinformatics上的差異可變剪接算法ASD和CASH等;并助力研究團隊發(fā)表Nature、Cancer Cell在內(nèi)的300+ 高質量轉錄組相關學術期刊文章,如助力中科院頂級研究團隊在Nature發(fā)表全球首例自閉癥猴模型等。
圖2:引自 Liu Z, et al. Nature., 2016
2023年9月,烈冰上線了CytoNavigatorTM單細胞數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),并在全國開展了多次線下培訓班,獲得了大量老師的認可和使用。
本次我們推出的轉錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)側重分析的全面性、靈活性和流暢性,用戶可在平臺上流暢進行各類數(shù)據(jù)分析,快速挖掘數(shù)據(jù)背后的生物學意義。
02 烈冰轉錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)優(yōu)勢
可交互頁面全面覆蓋各類分析
圖3:WGCNA分析頁面,選擇基因module后實時展示該基因module所影響的Pathway
系統(tǒng)全面覆蓋差異基因、功能分析、聚類分析、網(wǎng)絡圖、GSEA、趨勢分析、WGCNA等多種高級數(shù)據(jù)分析模塊。每個分析模塊均可隨意調整參數(shù),并進行深度分析。
功能分析和網(wǎng)絡分析圖毫秒級展示
圖4:對差異基因進行交并集分析,并對結果進行各類功能分析
毫秒級計算比較組之間的交集和并集,調整差異基因的卡值(Pvalue、FDR)后實時計算網(wǎng)絡圖、各種功能分析和聚類分析圖,順滑繪圖。
用戶界面友好,分析功能全面
圖5:清晰的分析流程,全面覆蓋各類高級分析,并支持一鍵提交分析
支持多種主流的數(shù)據(jù)分析工具和算法包,用戶可一鍵提交整個分析流程,也可根據(jù)需要修改各類參數(shù)進行定制化分析,兼顧一鍵分析和反復調參。
清晰全面的幫助文檔,降低學習成本
圖6:每個分析工具均提供全面的幫助手冊
幫助手冊助力用戶進行高效的結果解讀。
分析高度可定制化
圖7:可實時查看每個趨勢所包含的基因,并對其進行功能分析
單頁面同時展示基因表達、趨勢、火山圖、GO/Pathway、KEGG map、PPI網(wǎng)絡等一系列分析。同時每個結果都支持用戶自行調整結果,實時出圖。
03 平臺注冊流程
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