置 頂烈冰生物：探索單細胞前沿，助力國自然熱點領(lǐng)域研究
截止2024年8月底，烈冰生物已為國內(nèi)多家醫(yī)院和科研機構(gòu)提供支持，助力300+CNS國際學術(shù)期刊文章發(fā)表，IF10+文章占比＞60%。本次小編篩選部分代表性文章，帶大家了解單細胞測序技術(shù)應(yīng)用于國自然熱點研究領(lǐng)域的研究思路。
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單細胞/空轉(zhuǎn)/轉(zhuǎn)錄組/生物信息
截止2024年8月底，烈冰生物已為國內(nèi)多家醫(yī)院和科研機構(gòu)提供支持，助力300+CNS國際學術(shù)期刊文章發(fā)表，IF10+文章占比＞60%。本次小編篩選部分代表性文章，帶大家了解單細胞測序技術(shù)應(yīng)用于國自然熱點研究領(lǐng)域的研究思路。
烈冰生物合作伙伴上海交通大學醫(yī)學院附屬仁濟醫(yī)院薛婧團隊于近期在CancerCell期刊發(fā)表了題為：Tumorcell-intrinsicepigeneticdysregulationshapescancer-associatedfibroblastsheterogeneitytometabolicallysupportpancreaticcancer的研究論文。作者基于臨床數(shù)據(jù)以及小鼠腫瘤模型的單細胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)，鑒定出一類獨特的富脂型CAF亞群，并詳細解析了SETD2缺失型的胰腺腫瘤調(diào)控CAF異質(zhì)性、以及富脂型CAF如何促進腫瘤細胞代謝重塑的交互機制。烈冰生物參與了本研究中的單細胞測序?qū)嶒灪蛿?shù)據(jù)分析工作。發(fā)表日期：2024年4月
繼上次公布NovelCyto實驗現(xiàn)場過程后（戳這里了解獲取詳情），大家對下機測序數(shù)據(jù)分析的結(jié)果非常關(guān)注?。。ovelCyto的實力到底如何？今天烈小冰就用實測數(shù)據(jù)，帶您進行全方位了解！實驗流程樣本信息：小鼠胚胎組織（數(shù)據(jù)量>100G/樣本）實驗設(shè)計：Batch1、Batch2（兩次生物學重復，均使用烈冰自研NovelCyto單細胞捕獲方案）注：以下實測數(shù)據(jù)結(jié)果均來源于同一樣本（小鼠胚胎組織）解離后的細胞懸液，在相同實驗條件下（時間，儀器，試劑，初始上機細胞數(shù)等）完成。實戰(zhàn)數(shù)據(jù)測評01測序數(shù)據(jù)均達國際一線水平實際數(shù)據(jù)情況：以上便是此次烈小冰為大家?guī)淼臄?shù)據(jù)分析實戰(zhàn)測評結(jié)果。總的來說，NovelCyto微孔法重力沉降單細胞捕獲方
烈冰生物合作伙伴華中科技大學同濟醫(yī)學院附屬同濟醫(yī)院諶科教授、陶振教授、管維教授和海軍軍醫(yī)大學附屬長征醫(yī)院任善成教授發(fā)表在《NatureGenetics》的文章影響因子：IF=30.8實驗設(shè)計研究團隊使用，對100份未經(jīng)治療的ccRCC樣本和50份配對的正常鄰近組織（NATs）進行了分析?；蚪M的分析結(jié)果表明本研究中最頻繁的突變基因與之前的研究一致；轉(zhuǎn)錄組和蛋白組的數(shù)據(jù)表明，腫瘤和正常臨近組織（NATs）之間有顯著的區(qū)別。代謝組學分析結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組分析的結(jié)果一致，并發(fā)現(xiàn)ccRCC的一個標志，研究團隊從一個公開的scRNA-seq數(shù)據(jù)集生成了一個ccRCC的特征矩陣，。其中，IM1腫瘤的特征是內(nèi)皮細胞和基質(zhì)細胞特征豐富，免疫細胞
皮膚是身體最大的器官，由表皮和真皮組成，并包含毛囊(hairfollicle,HF）等附屬器官，在體溫調(diào)節(jié)、身體保護、新陳代謝和感知等方面發(fā)揮重要作用。毛囊(HF)形態(tài)發(fā)生可分為誘導期(Induction)、器官形成期(Organogenesis)和細胞分化期(Cytodifferentiation)三個階段。在HF形態(tài)發(fā)生過程中，最初可觀察到的結(jié)構(gòu)是誘導期的毛囊基板(hairplacode,Pc)。然而，早期胚胎皮膚細胞的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜還沒有被完整地描述過，這對于人體皮膚相關(guān)疾病的研究非常重要。
圖1：CytoNavigator轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)的差異基因頁面正式推出CytoNavigatorTM轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)！一次解決RNA-seq分析的痛點，讓您享受數(shù)據(jù)分析的過程，輕松獲得高質(zhì)量文章級圖片。烈冰生物自2010年起即深耕轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域，公司自主研發(fā)了多個轉(zhuǎn)錄組相關(guān)算法，如發(fā)表在期刊核酸研究以及BriefingsInBioinformatics上的差異可變剪接算法ASD和CASH等；并助力研究團隊發(fā)表Nature、CancerCell在內(nèi)的300+高質(zhì)量轉(zhuǎn)錄組相關(guān)學術(shù)期刊文章，如助力中科院頂級研究團隊在Nature發(fā)表全球首例自閉癥猴模型等。圖2：引自LiuZ,etal.Nature.,2016本次我們推出的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系
對2023年部分重點文獻進行了梳理，希望能夠更好的幫到科研工作者~發(fā)表時間：202305單細胞捕獲平臺：烈冰10XGenomics平臺研究亮點：研究團隊通過基因工程編輯小鼠、PDX小鼠等模型，利用單細胞測序技術(shù)，以及大量的功能實驗驗證，揭示了雄激素剝奪治療（ADT）誘導的SPP1+myCAFs是驅(qū)動去勢抵抗性前列腺癌（CRPC）發(fā)展的關(guān)鍵基質(zhì)成分，并深入研究了該群CAFs的起源與作用機制。原文鏈接：DOI：10.1016/j.ccell.2023.05.016起始過程中的癌前病變發(fā)表期刊：CellDiscoveryIF=33.5采樣組織：人的口腔組織DOI:10.1038/s41421-023-00532-43NNMT富集AQP5+
