烈冰科技創(chuàng)始至今，每一個(gè)項(xiàng)目圍繞客戶需求展開，定制最適合的方案，只要您有需要，烈冰就為您出力。我們竭盡全力讓每一個(gè)信任我們的客戶滿意，并花費(fèi)大量人力、物力和時(shí)間。烈冰擁有一支具有一流水平的生物信息分析團(tuán)隊(duì)，旨在高效率提供標(biāo)準(zhǔn)流程化的生物信息分析，同時(shí)根據(jù)不同的項(xiàng)目需求，提供定制化的深度數(shù)據(jù)挖掘服務(wù)。當(dāng)然除了數(shù)據(jù)分析外，烈冰的團(tuán)隊(duì)也可以為研究者的課題做出嚴(yán)謹(jǐn)?shù)慕ㄗh。烈小冰覺得，比起所謂的價(jià)格優(yōu)勢(shì)，時(shí)間優(yōu)勢(shì)，物超所值或者至少物有所值才是更重要的，這也是烈冰的服務(wù)宗旨，以客戶為根本，提高客戶幸福感。

網(wǎng)絡(luò)圖太難、種類太多難以選擇？烈冰幫你搞定

基因互作網(wǎng)絡(luò)

研究中，常常會(huì)發(fā)現(xiàn)差異基因過多，并且所屬信號(hào)通路也很復(fù)雜，難以將相關(guān)基因聯(lián)系起來(lái)并找到“核心”基因。烈冰團(tuán)隊(duì)整合基因間相互作用關(guān)系，并采用網(wǎng)絡(luò)圖展示差異基因間復(fù)雜的互作網(wǎng)絡(luò)/信號(hào)傳遞網(wǎng)絡(luò)，幫助研究者快速定位到“核心”基因。

Sun L et al., Sci Rep, 2016

共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)

對(duì)于已知注釋信息進(jìn)入深入的分析挖掘之后，研究者往往希望能夠找到更多的創(chuàng)新點(diǎn)。烈冰團(tuán)隊(duì)基于轉(zhuǎn)錄組基因的實(shí)測(cè)表達(dá)值，為研究者構(gòu)建基于統(tǒng)計(jì)學(xué)和“圖論”原理的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，通過研究處理前后共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)變化，了解基因間的潛在關(guān)系和規(guī)律，進(jìn)一步找到實(shí)驗(yàn)處理前后發(fā)生改變的關(guān)鍵基因進(jìn)行深入研究。

GO-Tree分析

在得到差異基因及其顯著富集的GO功能條目后，烈冰團(tuán)隊(duì)為研究者構(gòu)建并提供GO-Tree功能樹，通過該分析，研究者可以清晰的總結(jié)研究的核心基因所影響的生物學(xué)過程。

Miao et al., Mol Cell Endocrinol, 2015

可變剪接驗(yàn)證率太低很苦惱？烈冰幫你搞定

烈冰團(tuán)隊(duì)早在2014年即自主研發(fā)了高驗(yàn)證率可變剪接算法ASD （Alternative Splicing Detector，網(wǎng)址：http://www.nimdoo.com/asd/ASD.html），該算法發(fā)布后即被大量文獻(xiàn)引用，其中不乏Nature Communications、PloS Genetics 等高分期刊。17年烈冰研發(fā)總監(jiān)宗杰博士率生物信息研發(fā)團(tuán)隊(duì)開發(fā)的“進(jìn)階級(jí)”可變剪接分析算法CASH（Comprehensive AS Hunting，網(wǎng)址:https://sourceforge.net/projects/cash-program/），無(wú)論在有生物學(xué)重復(fù)還是無(wú)生物學(xué)重復(fù)樣本中，CASH都顯著提升了樣本之間差異可變剪接事件的檢測(cè)能力，尤其是新的可變剪接事件，驗(yàn)證準(zhǔn)確率高達(dá)70%！在針對(duì)不同測(cè)序深度數(shù)據(jù)的測(cè)試中，CASH始終表現(xiàn)出優(yōu)于其他算法的檢測(cè)率。即使是在低數(shù)據(jù)量下，CASH依舊力壓其他算法，始終維持著極高的敏感性及特異性。

CASH算法檢測(cè)效率驗(yàn)證

烈冰團(tuán)隊(duì)利用Flux模擬器模擬了一系列數(shù)據(jù)，其中包含已有注釋的以及新的差異可變剪接事件，測(cè)序深度分為30x，50x和100x。結(jié)果顯示MISO，rMATS以及DEXSeq在使用重建后轉(zhuǎn)錄本的情況下，其檢測(cè)效率要高于使用參考基因組，但還是顯著低于CASH。即使是在30x的數(shù)據(jù)量下，CASH依舊能夠維持著極高的敏感性及特異性。

Wu et al., Brief Bioinform, 2017

烈冰團(tuán)隊(duì)一研究不夠深入？烈冰幫你搞定

ceRNA分析

lncRNA可作為ceRNA（competing endogenous RNA，競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA）與miRNA相互作用，參與靶基因的表達(dá)調(diào)控，并在多種疾?。ɡ绾芏鄬W(xué)者研究的腫瘤）的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。烈冰團(tuán)隊(duì)整合多種算法，協(xié)助研究者完成lncRNA-miRNA-mRNA互作網(wǎng)絡(luò)圖，直觀的展示這三者之間的調(diào)控關(guān)系。

Miao et al., Sci Rep, 2016

circRNA也可以作為ceRNA（competing endogenous RNA，競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA）與miRNA結(jié)合，影響基因的調(diào)控表達(dá)。烈冰團(tuán)隊(duì)協(xié)助研究者對(duì)其進(jìn)行分析，從而進(jìn)一步研究circRNA對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控作用。

Huang et al., Nat Commun, 2016

甲基化-mRNA聯(lián)合分析

基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化能影響基因表達(dá)，可變剪接位點(diǎn)甲基化影響基因可變剪接發(fā)生，轉(zhuǎn)座子區(qū)甲基化影響轉(zhuǎn)座子活動(dòng)，種種因素使得很多研究者對(duì)甲基化和轉(zhuǎn)錄組的聯(lián)合分析很感興趣，烈冰的生信團(tuán)隊(duì)會(huì)根據(jù)項(xiàng)目情況，設(shè)計(jì)最合適的研究切入點(diǎn)，協(xié)助研究者找到關(guān)鍵基因。

Spencer DH et al., Cell, 2017

小RNA和甲基化相關(guān)性分析

小RNA和甲基化之間的聯(lián)系也相當(dāng)緊密，如小RNA產(chǎn)生位點(diǎn)基因啟動(dòng)子區(qū)DNA甲基化影響小RNA表達(dá)，小RNA通過調(diào)控甲基轉(zhuǎn)移酶影響基因甲基化水平等，烈冰團(tuán)隊(duì)會(huì)根據(jù)客戶實(shí)際研究，設(shè)計(jì)最佳生信分析方案。

Coruh et al., Plant Cell, 2015

樣本過于復(fù)雜難以下手分析？烈冰幫你搞定

WGCNA功能預(yù)測(cè)

WGCNA（Weighted Gene Co-expression Network Analysis，加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)）是一個(gè)基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)，構(gòu)建基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的方法。烈冰團(tuán)隊(duì)協(xié)助研究者利用WGCNA進(jìn)行功能預(yù)測(cè)，根據(jù)基因表達(dá)模式，將基因進(jìn)行分組。例如在circRNA的功能研究中，可以根據(jù)“凡是能夠互相形成共表達(dá)關(guān)系并且成簇的基因，具有類似的功能”，認(rèn)為circRNA和它所屬簇中mRNA具有類似的功能，并且可以通過mRNA所富集功能和信號(hào)通路對(duì)circRNA對(duì)于表型的影響進(jìn)行預(yù)測(cè)。

Wang et al., Frontiers in plant science, 2017

烈小冰介紹得比較粗略，也不夠全面，要是感興趣，可以直接聯(lián)系我們的銷售詳細(xì)咨詢，您專屬的方案咨詢顧問會(huì)為您設(shè)計(jì)定制化方案。

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其實(shí)，說到定制化，烈小冰要再為大家推薦烈冰團(tuán)隊(duì)耗時(shí)8年開發(fā)的NovelBrain®云計(jì)算平臺(tái)。該平臺(tái)是行業(yè)內(nèi)實(shí)現(xiàn)高度定制化分析的云計(jì)算平臺(tái)，烈冰科技充分考慮到了生物信息大數(shù)據(jù)分析的復(fù)雜性和特殊性，NovelBrain®云計(jì)算系統(tǒng)不僅能新建或修改工作流，而且能在分析運(yùn)行前、運(yùn)行中、運(yùn)行后均可任意修改和運(yùn)行分析流程，并保證分析過程可追溯和可重現(xiàn)，真正實(shí)現(xiàn)生物大數(shù)據(jù)分析的高度定制化。

烈冰的服務(wù)沒有太多華麗的噱頭和頻繁促銷，我們把所有的精力都投入到了精益求精中，給客戶更優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。您有需求，烈冰幫您完成，以客戶為根本，提高客戶幸福感，烈冰一直都是這樣堅(jiān)持的，以后也會(huì)繼續(xù)堅(jiān)持。如果您有任何關(guān)于實(shí)驗(yàn)或生信的想法和需求，請(qǐng)直接與當(dāng)?shù)劁N售或撥打021-51827998與我們聯(lián)系，烈小冰竭誠(chéng)恭候。