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NovelBrain?單細胞測序?qū)嶒?數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班第一期圓滿落幕 時間:2020-01-07

2019年1216 -20日,NovelBrain®單細胞測序?qū)嶒?span>&數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班第一期開班授課。本期學(xué)員分別來自上海、北京、南京、山西、江西等地的各大高校、科研院所及各附屬醫(yī)院,包括中科院生物物理所、中科院上海生命科學(xué)研究院、北京航空航天大學(xué)、海軍軍醫(yī)大學(xué)、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院、九江學(xué)院等科研院所以及上海市第一人民醫(yī)院、上海市第十人民醫(yī)院、瑞金醫(yī)院、長海醫(yī)院、中山醫(yī)院、長征醫(yī)院、仁濟醫(yī)院、新華醫(yī)院、宣武醫(yī)院、東方肝膽外科醫(yī)院、北京天壇醫(yī)院、山西白求恩醫(yī)院、南京鼓樓醫(yī)院等附屬醫(yī)院。


本次課程由烈冰講師“天團”進行授課:技術(shù)總監(jiān)張博、項目總監(jiān)洪艷艷、生信主任郭云雷齊上陣,向?qū)W員講授單細胞測序?qū)嶒?span>&數(shù)據(jù)分析,包括:單細胞測序研究進展及細胞捕獲原理介紹、測序數(shù)據(jù)分析策略解讀、單細胞測序原始數(shù)據(jù)預(yù)處理、分析平臺實踐上機操作及結(jié)果文件解讀、分析結(jié)果圖形化展示以及單細胞懸液制備和捕獲實驗操作等。



培訓(xùn)內(nèi)容:


單細胞測序研究進展及細胞捕獲原理

l  單細胞測序研究進展;

l  兩大主流平臺10×BD單細胞捕獲原理;

l  10×BD單細胞捕獲的優(yōu)缺點;

l  10×BD建庫方法;

l  TCR、BCR、靶向測序、Ab-Seq等技術(shù)相關(guān)知識介紹;

單細胞測序?qū)嶒炘O(shè)計及案例分析

l  單細胞測序經(jīng)典文獻解讀——腫瘤;

l  單細胞測序經(jīng)典文獻解讀——神經(jīng);

單細胞測序原始數(shù)據(jù)預(yù)處理

l  10×BD下機原始數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)講解;

l  10×BD 不同平臺的數(shù)據(jù)預(yù)處理策略;

l  細胞數(shù)量判斷;

l  數(shù)據(jù)質(zhì)量評估;

l  數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化;

單細胞測序數(shù)據(jù)分析策略

l  單細胞測序數(shù)據(jù)分析流程,包括細胞類型鑒定、擬時序分析、SCENIC分析、CellPhone、inferCNV等等;

l  單細胞數(shù)據(jù)分析涉及的相關(guān)生物信息學(xué)算法和數(shù)據(jù)庫的介紹和選擇;

單細胞云平臺介紹及上機實踐操作

l  單細胞云平臺功能模塊介紹,包括項目管理、工作流搭建、數(shù)據(jù)進程監(jiān)控、結(jié)果報告和單細胞瀏覽器等;

l  單細胞云平臺實際操作,包括新建項目、上傳數(shù)據(jù)、搭建Pipeline、數(shù)據(jù)分析;

單細胞數(shù)據(jù)分析結(jié)果圖形化展示

l  如何通過云平臺獲得可供SCI發(fā)表的圖形化結(jié)果

單細胞結(jié)果解讀及參數(shù)調(diào)試

l  單細胞數(shù)據(jù)分析結(jié)果文件解讀;

l  Task參數(shù)在單細胞數(shù)據(jù)分析中的重要性

單細胞測序?qū)嶒炞⒁馐马?span>

l  單細胞測序?qū)嶒灮玖鞒蹋?/span>

l  單細胞懸液制備注意事項;

單細胞懸液制備和捕獲實驗操作

l  小鼠來源樣本單細胞懸液制備;

l  WTA/Ab-Seq實驗演示;


每天課程結(jié)束,烈小冰都會收集整理學(xué)員的反饋意見,針對學(xué)員提出的問題和意見及時對課程進行調(diào)整和完善,保證學(xué)員可以在高強度課程中吸收重點內(nèi)容,讓每位學(xué)員聽得懂、記得住、做得會、玩得轉(zhuǎn)單細胞測序~



為了使學(xué)員們能有足夠的能量應(yīng)對高強度的學(xué)習(xí)壓力,烈小冰悉心準(zhǔn)備了豐富的飲品零食、水果,還有豐盛的午飯,為大家創(chuàng)造更好的培訓(xùn)環(huán)境。


課程結(jié)束之后,學(xué)員進公司參觀,并獲得本次培訓(xùn)班的結(jié)課榮譽證書,以鼓勵各位學(xué)員認真的學(xué)習(xí)態(tài)度。


錯過第一期培訓(xùn)的老師不要著急,烈冰單細胞測序&數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班第二期正在加緊籌劃中~  2020年,烈小冰與您不見不散!