烈冰智造 | 自動化組織解離儀:超越傳統(tǒng),精準揭示小鼠膀胱癌皮下瘤組織的單細胞奧秘
組織解離樣本 ——小鼠膀胱癌皮下瘤組織
小鼠膀胱癌皮下瘤組織是一種在小鼠皮下移植癌細胞形成的腫瘤模型,常用于癌癥研究。接下來,我們將對小鼠膀胱癌皮下瘤組織進行同步處理,應用烈冰智造自動化組織解離儀與傳統(tǒng)水浴震蕩法進行對比實驗,以揭示兩種技術在組織解離效果上的差異。
實驗方案對比
1、烈冰智造自動化組織解離儀組織解離流程:
組織消化
樣本上機—溫度設置—物種以及組織類型選擇設置—點擊運行
(觸控界面顯示樣本解離剩余時間)
過篩(從上圖可以觀察到經過烈冰智造自動化組織解離儀進行組織消化后碎片、雜質非常少)
2、傳統(tǒng)水浴震蕩法組織解離流程:
37℃水浴鍋震蕩
實驗結果對比
1、單細胞懸液質控:
以上結果可以觀察到,利用烈冰智造自動化組織解離儀制備的單細胞懸液的細胞活率與傳統(tǒng)水浴震蕩法相當。而相較于傳統(tǒng)水浴震蕩法,烈冰智造自動化組織解離儀組織消化獲得更高的細胞濃度以及更多的細胞數。這一結果不僅驗證了自動化組織解離儀在溫和高效地消化組織方面的優(yōu)異表現(xiàn),也突顯了其高樣本回收率的優(yōu)勢。
接著利用烈冰智造的NovelCyto平臺進行細胞捕獲,隨后完成文庫構建,上機測序。接著進行數據分析,采用烈冰CytoNavigatorTM單細胞數據分析系統(tǒng),對通過烈冰智造自動化組織解離儀處理的小鼠膀胱癌皮下瘤組織樣本與傳統(tǒng)水浴震蕩法所得數據結果的詳細對比分析:
2、細胞質控:
烈冰智造自動化組織解離儀組織消化和傳統(tǒng)水浴震蕩法均獲得高質量的測序數據:烈冰智造自動化組織解離儀組織消化方法上機測序最終捕獲細胞數為10737,中位基因值為3017;傳統(tǒng)水浴震蕩法上機測序最終捕獲細胞數為10729,中位基因值為2805,低于自動化組織解離儀的處理結果。這一結果展示了烈冰智造自動化組織解離儀獲取高質量細胞和基因表達的完整性方面的優(yōu)勢。
3、細胞類型鑒定以及細胞計數和占比統(tǒng)計:
根據特征marker基因表達,共鑒定出九種細胞類型,包括T細胞、巨噬細胞、單核細胞、樹突狀細胞、粒細胞-巨噬細胞祖細胞、中性粒細胞、內皮細胞、成纖維細胞和腫瘤細胞。
根據細胞計數和占比統(tǒng)計結果,我們發(fā)現(xiàn)對于實質細胞的獲取,烈冰智造自動化組織解離儀組織消化得到的內皮細胞數量為142,成纖維細胞數量為459;而傳統(tǒng)水浴震蕩法得到的內皮細胞數量為64,成纖維細胞數量為340。這一顯著的對比結果顯示清晰地揭示了烈冰智造自動化組織解離儀在獲取更多數量的實質細胞方面的優(yōu)勢。
4、結果總結:
通過烈冰智造自動化組織解離儀與傳統(tǒng)水浴震蕩法同步對小鼠膀胱癌皮下瘤組織進行解離消化的對比實驗,從單細胞懸液質控、細胞質控以及獲取不同細胞類型的數量等方面比較了兩種組織解離方法的解離效果。烈冰智造自動化組織解離儀在單細胞懸液制備上展現(xiàn)出以下優(yōu)勢:
(1)解離獲得的單細胞懸液碎片、雜質更少
(2)獲取的單細胞懸液的細胞濃度更高,數量更多
(3)獲取細胞的基因表達完整性更好
(4)對實質細胞解離效果更好
烈冰智造自動化組織解離儀
烈冰智造的組織解離儀可將各類組織快速、徹底的解離為高質量的單細胞懸液。儀器的金屬浴模塊提供了精準溫控,螺旋槳式攪拌頭提供了柔和且穩(wěn)定的剪切力,相較于傳統(tǒng)方法,解離效率大幅提升。
傳統(tǒng)水浴震蕩法
VS
烈冰智造自動化組織解離儀組織消化
傳統(tǒng)的組織解離消化方法主要是通過水浴鍋震蕩的方式實現(xiàn),可能出現(xiàn)以下問題:
1.消化均勻性有偏差:震蕩消化可能無法保證組織樣本在水浴鍋中均勻受熱,導致消化不徹底或過度消化。
2.溫度控制不精確:水浴鍋可能難以提供精確的溫度控制,導致消化過程中溫度波動,影響酶的活性和細胞的完整性。
3.存在潛在的交叉風險:在多次消化過程中,使用相同的水浴鍋可能會增加樣本間交叉污染的風險。
4.可能存在實驗批次效應:由于依賴于操作者的經驗和技巧,傳統(tǒng)方法難以實現(xiàn)操作的標準化,這可能導致實驗結果的批次間差異。
烈冰智造自動化組織解離儀組織消化
相比之下,烈冰智造自動化組織解離儀可以有效克服這些不足,提高實驗的效率和結果的可靠性。產品核心優(yōu)勢主要有:
1.波輪與樣本非硬擠壓解離模式:使得組織所受的機械壓力最小化,從而保護了細胞的完整性和活性。同時正置旋轉技術確保了樣本在消化過程中的均勻受力,適用于各類軟硬組織。
2.精準溫控:金屬浴模塊實現(xiàn)精準溫控,迅速散熱,確保細胞活性,這一功能對于溫度敏感的細胞類型尤為重要,能夠有效避免溫度波動對細胞功能和完整性的不利影響。
3.交叉污染風險低:一次性耗材的使用顯著降低了交叉污染風險,確保了實驗結果的精準可靠。
4.實驗批次效應小:儀器可提供高度一致的消化效果,減少了實驗批次間的變異,保證了數據的一致性和可比性。
5.多樣化消化方案:針對不同組織類型的定制化消化方案,以適應各種組織的特性,從而提升實驗效率,確保樣本處理的一致性和結果的準確性。