精準(zhǔn)醫(yī)療，云計(jì)算勢(shì)在必行
美國(guó)總統(tǒng)奧巴馬宣布啟動(dòng)精準(zhǔn)醫(yī)療行動(dòng)后，國(guó)內(nèi)政策密集推動(dòng)，2016年3月，精準(zhǔn)醫(yī)療入選十三五100個(gè)重大項(xiàng)目?；驕y(cè)序是精準(zhǔn)醫(yī)療的前端，健康基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)乘風(fēng)飛起，現(xiàn)預(yù)估測(cè)序市場(chǎng)總?cè)萘窟_(dá)200億美元。HiSeq X Ten一天時(shí)間能產(chǎn)生6T數(shù)據(jù)，足以得到50個(gè)人類基因組，精準(zhǔn)醫(yī)療開(kāi)啟的大數(shù)據(jù)時(shí)代已正式到來(lái)。 但是，實(shí)際應(yīng)用中對(duì)大數(shù)據(jù)處理的運(yùn)算速度、穩(wěn)定性、可重復(fù)性的要求亦迅速提升。生物信息工具使用頻次和分析通量的快速提升，算法、軟件的不斷進(jìn)步和豐富，都讓分析人員自行尋找和改良算法成為一件相當(dāng)繁瑣的工作。生物云計(jì)算系統(tǒng)吸取互聯(lián)網(wǎng)大數(shù)據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在人力成本極低的情況下即可輕松解決數(shù)據(jù)管理、存儲(chǔ)、分析的問(wèn)題。

深度合作，出擊開(kāi)發(fā)醫(yī)療云
上海烈冰信息科技有限公司是一家專注于生命科學(xué)研究與大數(shù)據(jù)挖掘的高新技術(shù)企業(yè)，主營(yíng)業(yè)務(wù)涵蓋生物云計(jì)算、科研服務(wù)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)三大領(lǐng)域。列冰科技具有專業(yè)生物背景和六年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),積累深厚,服務(wù)于國(guó)內(nèi)200多家科研機(jī)構(gòu)，協(xié)助發(fā)表論文累計(jì)影響因子300以上。
海云生物科技圍繞基因檢測(cè)與云計(jì)算大數(shù)據(jù)分析來(lái)構(gòu)筑產(chǎn)品服務(wù)生態(tài)圈，具備生物技術(shù)（BT）與計(jì)算機(jī)技術(shù)（IT）化學(xué)反應(yīng)般融合的技術(shù)與管理團(tuán)隊(duì)，海云基因核心技術(shù)開(kāi)發(fā)人員主要來(lái)自原惠普公司的云計(jì)算架構(gòu)團(tuán)隊(duì)，在云計(jì)算及大數(shù)據(jù)處理上有豐富的經(jīng)驗(yàn)，曾經(jīng)負(fù)責(zé)過(guò)中國(guó)聯(lián)通、中國(guó)移動(dòng)的云平臺(tái)開(kāi)發(fā)項(xiàng)目。去年年底海云基因在業(yè)內(nèi)率先實(shí)現(xiàn)在線共享的基因云計(jì)算分析平臺(tái)GeneApps? 1.0后，通過(guò)一年來(lái)的匠心打造，特別是在近半年與烈冰科技的合作，在其豐富的生物信息經(jīng)驗(yàn)，以及烈冰科技開(kāi)發(fā)的基因大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)（NovelBrain®）的經(jīng)驗(yàn)支持下，雙方投入幾百萬(wàn)元以及二十余名計(jì)算機(jī)開(kāi)發(fā)人員和生物信息研發(fā)人員，合作推出海云基因云計(jì)算系統(tǒng)GeneApps? 2.0上線。
通過(guò)本次合作，使GeneApps? 2.0醫(yī)療云計(jì)算框架具備一套集高性能計(jì)算，項(xiàng)目管理，生物智能挖掘框架為一體的整合分析管理平臺(tái)，其中hadoop分布式計(jì)算框架，云計(jì)算底層技術(shù)已實(shí)現(xiàn)，并針對(duì)藥物基因組學(xué)、個(gè)性化用藥、基因體檢、遺傳性疾病、多發(fā)性腫瘤、液體活檢等應(yīng)用開(kāi)發(fā)了可拓展功能的API接口。平臺(tái)設(shè)計(jì)了疾病數(shù)據(jù)庫(kù)開(kāi)發(fā)模塊，可輕松實(shí)現(xiàn)公共數(shù)據(jù)庫(kù)錄入、患者數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建和定制化數(shù)據(jù)庫(kù)等功能，同時(shí)也支持結(jié)果報(bào)告定制、數(shù)據(jù)Panel定制等一系列定制化服務(wù)。
優(yōu)化的GeneApps? 2.0版本，具備基因組、外顯子組、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、微生物宏基因組和表觀遺傳學(xué)等模塊，現(xiàn)已實(shí)現(xiàn)數(shù)十條自動(dòng)化分析流程，具備百余個(gè)生信功能task簇，不僅能充分滿足用戶標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)分析需求，還能根據(jù)用戶的需求個(gè)性化選取添加新的task，實(shí)現(xiàn)完美的定制化分析流程服務(wù)。同時(shí)，通過(guò)烈冰科技提供的私有云計(jì)算框架，使用分布式計(jì)算和任務(wù)調(diào)度來(lái)加速數(shù)據(jù)分析速度和通量，大大提升數(shù)據(jù)分析效率和定制化水平，可進(jìn)行大規(guī)模的數(shù)據(jù)處理。

海云基因與烈冰科技旨在打造更加優(yōu)質(zhì)的基因檢測(cè)服務(wù)與數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，充分發(fā)揮各自優(yōu)勢(shì)，不僅為廣大客戶快速提供較大數(shù)據(jù)量的生物信息分析服務(wù)，也為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)測(cè)序企業(yè)、科研部門及醫(yī)院提供私有云平臺(tái)開(kāi)發(fā)服務(wù)，使用戶進(jìn)行更安全、更自由地?cái)?shù)據(jù)分析。
雙方通過(guò)長(zhǎng)達(dá)一年的技術(shù)交流與相互了解，最終達(dá)成了此次合作，希望為研發(fā)團(tuán)隊(duì)、科研機(jī)構(gòu)、臨床研究、檢測(cè)/測(cè)序服務(wù)商等提供高品質(zhì)的基因檢測(cè)與數(shù)據(jù)解讀服務(wù)。同時(shí)，雙方也將以此次合作為契機(jī)，持續(xù)開(kāi)展一系列交流合作，強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合，促使生命科學(xué)向更高層的研究領(lǐng)域突破。