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服務(wù)熱線02152235399

單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析可視化系統(tǒng)

集成單細(xì)胞分析結(jié)果可視化展示與交互式解讀為一體的軟件產(chǎn)品,無需依托任何服務(wù)機(jī)構(gòu),快速篩選單細(xì)胞分析結(jié)果的關(guān)鍵信息,自主繪制形式多樣的結(jié)果圖片,一站式串聯(lián)研究論著文章故事線。

頁簽功能實(shí)現(xiàn)

(一)QualityControl

展示單細(xì)胞分析流程上游的數(shù)據(jù)質(zhì)控和細(xì)胞判定環(huán)節(jié)的數(shù)據(jù)分析結(jié)果。

(二)CellBrowser

展示細(xì)胞降維聚類、細(xì)胞類群標(biāo)識基因分析、細(xì)胞類群標(biāo)識基因功能和通路分析、細(xì)胞類群在不同樣本分組下的豐度變化以及細(xì)胞類群在各個(gè)樣本細(xì)胞中占比的結(jié)果。

(三)Pseudotime

在線實(shí)時(shí)查看擬時(shí)序圖中隨著擬時(shí)序軌跡各細(xì)胞類群之間可能的演化關(guān)系,以及細(xì)胞類群或樣本的概率密度分布曲線。通過點(diǎn)擊擬時(shí)序圖中分支節(jié)點(diǎn),切換擬時(shí)序分支熱圖查看對應(yīng)的基因模塊,以及這些基因模塊對應(yīng)的功能通路分析結(jié)果。也可查看用戶關(guān)注的基因在擬時(shí)序圖中表達(dá)情況。

(四)CellPhone

用戶可在線實(shí)時(shí)通過熱圖 (HeatMap)/弦圖 (CircosPlot)查看各細(xì)胞類群作為配體受體之間潛在的交互作用。通過點(diǎn)擊指定條目,可在氣泡圖 (BubblePlot)/網(wǎng)絡(luò)圖 (PairNetWork)中查看蛋白互作的詳情,并在數(shù)據(jù)表中查閱到相關(guān)數(shù)據(jù)。

(五)QuSAGE

QuSAGE工具的主要內(nèi)容是基因表達(dá)集合定量分析的可視化展示與交互式解讀。

(六)SCENIC

SCENIC工具的主要內(nèi)容是轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析的可視化展示與交互式解讀。

文章排圖實(shí)例

以下圖片全部由單細(xì)胞可視化系統(tǒng)軟件繪制完成,并按照經(jīng)典單細(xì)胞文章圖片樣式排版

圖 1 : 膀胱癌的細(xì)胞圖譜

圖 2 :膀胱癌中內(nèi)皮細(xì)胞圖譜

圖 3 :膀胱癌中內(nèi)皮細(xì)胞的演化路徑及細(xì)胞間通訊